Родился 13 марта 1908 года в городе Нежине на Украине в семье служащего. Еврей.  Кончил среднюю школу и в 1932 году институт инженеров путей сообщения.

В Красной Армии с 1932 года. В 1935 году окончил Военную железнодорож­ную школу. Был начальником штаба же­лезнодорожного полка. В 1939 году окон­чил Военную академию имени М. В. Фрунзе. Служил начальником штаба стрелковой дивизии.

Все годы войны с нацистами (1941 — 1945) — на фронтах — коман­дир воздушно-десантной бригады (1941 год), с 1942 по 1945 год — командир стрелковой дивизии.

В мае 1945 представлен к званию Героя Советского Союза, но был награжден орденом Ленина.

Из наградного листа на присвоение звания Героя Советского Союза командиру 23-й гвардейской стрелковой дивизии, генерал-майору Шафаренко П.М.:

В период прорыва обороны противника на западном берегу р. Одер в районе Кинитц командир 23ГвСД Гвардии генерал-майор Шафаренко П.М. отлично подготовил свои части дивизии к операции, умело организовал взаимодействие пехоты с артиллерией и танками и управление боем. 16.04.1945 года части 23 ГвСД прорвали сильно укрепленную и глубоко эшелонированную оборону противника обеспечили ввод в бой 9 Гвардейский танковый корпус и с упорными боями за пять дней, преодолевая восемь укрепленных рубежей, форсировали три водных преграды, перерезали 11 шоссейных дорог, в том числе автомагистраль в районе Блюмберг, прошли свыше 70 километров и 21.04.1945 года первыми ворвались в пределы г. Берлин.
В уличных боях по очищению города Берлин части дивизии в период с 22 апреля по 2 мая 1945 года преодолевая сильное огневое сопротивление противника в исключительно тяжелых условиях прошли свыше 18 километров, заняли свыше 120 кварталов и улиц, выйдя 02.05.1945 года на правый берег реки Шпрее.
От понесенных больших потерь в живой силе и технике, обескровленный противник 02.05.1945 года капитулировал.
В результате боев части 23 ГвСД заняли 26 населенных пунктов и 3 города. Уничтожили: солдат и офицеров 5400, танков и СУ- 6, орудий разных калибров – 30, автомашин – 44, пулеметов – 50, минометов – 19. Взяли в плен 3340 солдат и офицеров противника, захвачены трофеи: танков и СУ – 22, орудий разных калибров – 99, бронетранспортеров – 9 и много другого военного имущества и вооружения.
Кроме того Гвардии генерал-майор Шафаренко в период 14 по 16 марта 1945 года успешно провел операции по разгрому и уничтожению Шнайдемюльской группировки противника в районе Радовиц в результате которой было уничтожено свыше 2100 и захвачено в плен до 1100 солдат и офицеров противника и нанесены ему большие потери в технике и захвачены большие трофеи.
В последующих боях в немецкой Померании части 23 ГвСД в период 4-8 марта 1945 года с боями прошли свыше 80 километров, форсировали пять водных преград, захватили три города и 600 населенных пунктов, нанесли большие потери в живой силе и технике противника и первыми вышли на реку Одер.
За отличную организацию боя, умелую организацию взаимодействия родов войск и управление частями дивизии на поле боя в наступательных операциях Гвардии генерал-майор Шафаренко Павел Менделеевич достоин представления к высшей Правительственной награде – присвоения звания Герой Советского Союза.

Командир 12-го стрелкового корпуса генерал-майор Филатов 

Командующий войсками 3-й ударной армии генерал-полковник Кузнецов

Член военного совета 3-й ударной армии генрал-майор Литвинов

4 мая 1945 года

Звание генерал-майора присвоено 27 ноября 1942 года, генерал-лейтенанта — 27 апреля 1962 года.

Награжден 8-ю боевыми орденами.

После войны — начальник штаба стрелкового корпуса, коман­дир дивизии (1946—1951 годы), заместитель командующего ар­мией (1951 — 1957 годы). С 1962 года — заместитель командующе­го войсками Сибирского военного округа.

Уволен в отставку 9 марта 1967 года.

Жил в Одессе.  

Умер 25 апреля 1988 года. Похоронен на Таировском кладбище.